Structural determinants underlying the adduct lifetime in the LOV proteins of <i>Pseudomonas putida</i>

نویسندگان

چکیده

The primary photochemistry is similar among the flavin-bound sensory domains of light–oxygen–voltage (LOV) photoreceptors, where upon blue-light illumination a covalent adduct formed on microseconds time scale between flavin chromophore and strictly conserved cysteine residue. In contrast, adduct-state decay kinetics vary from seconds to days or longer. molecular basis for this variation structurally LOV not fully understood. Here, we selected PpSB2-LOV, fast-cycling (τrec 3.5 min, 20 °C) short protein Pseudomonas putida that shares 67% sequence identity with slow-cycling 2467 homologous PpSB1-LOV. Based crystal structure PpSB2-LOV in dark state reported here, used comparative approach, which combined information dynamic (MD) simulations address mechanistic vastly different lifetimes two proteins. MD pointed toward dynamically distinct structural region, were subsequently targeted by site-directed mutagenesis introduced single- multisite substitutions exchanging them corresponding residues Collectively, data presented identify key amino acids Aβ-Bβ, Eα-Fα loops, Fα helix, such as E27 I66, play decisive role determining lifetime. Our results additionally suggest correlation solvent accessibility pocket add our understanding signaling will have important implications tuning behavior (on/off kinetics) LOV-based optogenetic tools.

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

the underlying structure of language proficiency and the proficiency level

هدف از انجام این تخقیق بررسی رابطه احتمالی بین سطح مهارت زبان خارجی (foreign language proficiency) و ساختار مهارت زبان خارجی بود. تعداد 314 زبان آموز مونث و مذکر که عمدتا دانشجویان رشته های زبان انگلیسی در سطوح کارشناسی و کارشناسی ارشد بودند در این تحقیق شرکت کردند. از لحاظ سطح مهارت زبان خارجی شرکت کنندگان بسیار با هم متفاوت بودند، (75 نفر سطح پیشرفته، 113 نفر سطح متوسط، 126 سطح مقدماتی). کلا ...

15 صفحه اول

a structural survey of the polish posters

تصویرسازی قابلیتهای فراوانی را دارا است

15 صفحه اول

romantic education:reading william wordsworths the prelude in the light of the history of ideas

عصر روشنگری زمان شکل گیری ایده های مدرن تربیتی- آموزشی بود اما تاکید بیش از اندازه ی دوشاخه مهم فلسفی زمان یعنی عقل گرایی و حس گرایی بر دقت و وضوح، انسان عصر روشنگری را نسبت به دیگر تواناییهایش نابینا کرده و موجب به وجود آمدن افرادی تک بعدی شد که افتخارعقلانیتشان، تاکید شان بر تجربه فردی، به مبارزه طلبیدن منطق نیاکانشان وافسون زدایی شان از دنیا وتمام آنچه با حواس پنجگانه قابل درک نبوده و یا در ...

the analysis of the role of the speech acts theory in translating and dubbing hollywood films

از محوری ترین اثراتی که یک فیلم سینمایی ایجاد می کند دیالوگ هایی است که هنرپیش گان فیلم میگویند. به زعم یک فیلم ساز, یک شیوه متأثر نمودن مخاطب از اثر منظوره نیروی گفتارهای گوینده, مثل نیروی عاطفی, ترس آور, غم انگیز, هیجان انگیز و غیره, است. این مطالعه به بررسی این مسأله مبادرت کرده است که آیا نیروی فراگفتاری هنرپیش گان به مثابه ی اعمال گفتاری در پنج فیلم هالیوودی در نسخه های دوبله شده باز تولید...

15 صفحه اول

the effect of taftan pozzolan on the compressive strength of concrete in the environmental conditions of oman sea (chabahar port)

cement is an essential ingredient in the concrete buildings. for production of cement considerable amount of fossil fuel and electrical energy is consumed. on the other hand for generating one tone of portland cement, nearly one ton of carbon dioxide is released. it shows that 7 percent of the total released carbon dioxide in the world relates to the cement industry. considering ecological issu...

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: FEBS Journal

سال: 2021

ISSN: ['1742-464X', '1742-4658']

DOI: https://doi.org/10.1111/febs.15785